海运舱单系统是面向运输代理公司企业和报关行企业的应用系统，该系统分为本地业务处理系统和平台业务处理系统。平台系统是船代同报关行共同使用的，是处理装船单系统的。平台端业务处理系统分三个部分：海运舱单报关行业务处理系统、海运舱单船代业务处理系统、平台端后台管理系统。其中海运舱单报关行业务处理系统、海运舱单船代业务处理系统是在Internet上运行的，平台端后台管理系统不对外开放由EDI网络中心负责维护。海运舱单报关行业务处理系统主要完成报关行对出口装船单的采集、递交以及对企业、船代的业务统计和进行企业客户管理、查看船代发布的信息的功能。海运舱单船代业务处理系统主要完成船代对出口装船单的审核、导入或发布船期、发布公告信息以及对出口装船单报文的下载的功能。
本地系统是船代用的，不对报关行开放，用于处理清洁舱单和进口舱单。本地业务处理系统是运输代理公司企业内部Intranet网络平台上运行的，进行船期管理、进出口舱单管理、统计、收费、打印等本地业务的处理系统。由于该系统只在企业内部网络上运行，所以系统的安全性较高。
使用用户：船代
处理业务：船期发布、进出口单证的管理、单证打印、港建费维护
远程业务处理系统
使用用户：报关行、船代
处理业务：船期发布、出口装船单的发布、装船的审核等。
出口舱单电子数据预申报和备案操作流程
进口舱单电子数据预申报和备案操作流程
